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超速離心機的分離原理是，當一個含有聚合物或巨分子的溶液，在離心力是重力的25萬倍時，分子相互分離，純溶劑留在界面以上，這個界面以一定速度向容器底部移動。若溶質的分子量不均勻，這個界面上的濃度梯度也不均勻，則那些分子量低的會落在大分子之后。用光學儀器可觀察出這個界面，從而測定沉降速率，而每種成分的沉降速率又與其分子量有關，因而可以計算出各成分的分子量。超速離心機不僅能分離膠粒，更重要的是它能測定膠粒的沉降速率、平均分子量及混合體系的重量分布，因而在膠體化學研究(尤其是親液膠體)中起了重大的作用。
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